Transformers seharusnya menjadi titik balik dalam karir Megan Fox. Perannya di franchise Transformers adalah salah satu peran terbesar yang Megan Fox dapatkan sepanjang karirnya disaat ia sedang berkembang menuju puncak ketenarannya. Perannya di Transformers diperkirakan akan membawanya menjadi aktris papan atas Hollywood. Namun sayangnya hal itu tidak terjadi karea Megan Fox memutuskan untuk meninggalkan franchise itu setelah film kedua.
Di franchise Transformers, Megan Fox berperan sebagai Mikaela Banes, kekasih dari Sam Witwicky yang diperankan oleh Shia LaBeouf. Keduanya bahu-membahu dengan Autobots saat Decepticons mengancam kesejahteraan Bumi. Di akhir film kedua, Mikaela dan Sam menyatakan cinta mereka. Tapi di film Transformers: Dark of the Moon, posisi Mikaela Banes digantikan oleh seorang gadis baru bernama Carly (Rosie Huntington-Whiteley).
Michael Bay tidak pernah memiliki reputasi yang baik sebagai sutradara Hollywood. Dia pernah dituduh menuntut pemain dan krunya di setiap set untuk hal yang tidak perlu. Dalam sebuah wawancara pada tahun 2009 dengan Wonderland Magazine, Megan Fox mengecam Michael Bay. Dia mengatakan kepada publik bahwa Michael Bay ingin mengabadikan reputasi buruknya, dan bahkan Megan Fox membandingkannya dengan HitIer. Menurut Cosmopolitan, Steven Spielberg, yang merupakan produser Transformers, mengetahui komentar Megan Fox itu dan menyarankan kepada Michael Bay untuk memecatnya.
Baca juga: Brie Larson Ungkap Alasan Mengharukan Mengapa Dirinya Ingin Menjadi Captain Marvel
Dalam wawancara GQ di tahun 2011 yang mempromosikan Dark of the Moon, sutradara menanggapi komentar Megan Fox dengan mengabaikannya. Dia berkata bahwa Fox suka membangkitkan orang, dan selalu melakukannya dengan cara yang salah. Michael Bay membela diri dan menyatakan bahwa dia hanya meminta para aktornya untuk datang tepat waktu dan terkadang bekerja selama berhari-hari di lokasi syuting.
Setelah dipecat dari Transformers, Megan Fox menjadi tidak disukai di dunia Hollywood untuk jangka waktu tertentu. Dalam wawancara di Cosmopolitan, Megan Fox menyatakan menyesal atas perilakunya dan mengatakan bahwa dipecatnya dirinya dari Transformer adalah titik terendah dalam karirnya. Dia masih muda, baru berusia 23 tahun saat itu, dan percaya bahwa tindakannya benar. Alih-alih menjadi aktris top Hollywood, Megan Fox memilih karier yang lebih santai. Dia menjadi peran pendukung dalam film This Is 40 karya Judd Apatow dan peran berulang di sitkom hit New Girl. Jika saja insidennya dengan Michael Bay tidak pernah terjadi, kemungkinan saat ini Megan Fox akan mendapatkan lebih banyak peran penting dan peran utama dalam film-film besar.
Pengalaman Megan Fox hanya sebagian kecil dari dunia gelap bekerja di Hollywood, yaitu satu kesalahan dan seorang aktor akan disingkirkan. Untungnya, Megan Fox dan Michaell Bay akan bekerja sama lagi, meskipun secara tidak langsung. Megan Fox akan berperan di film Teenage Mutant Ninja Turtles reboot, yang diproduksi oleh Michael Bay.
